深入糖蛋白组学和糖组学分析的高级解决方案

高灵敏度分析

整合的聚糖从头测序和糖肽数据库搜索提高了糖肽鉴定的灵敏度，同时能够发现隐藏的糖肽。使用两种独立方法评估每个MS2谱图，可提高置信度并增加糖蛋白质组学鉴定深度。

增强聚糖结构解析可信度

GlycanFinder 采用基于结构的糖肽鉴定方式。S-Score (%)用于表征所选糖肽结构相较于其他聚糖同分异构体候选物的支持程度。

Glycan de novo

糖链从头测序能够发现含有罕见或意外糖链的糖肽。以下来自昆虫数据集的示例凸显了这一能力。

InChorus – 跨软件结果比对

PEAKS GlycanFinder凭借其强大的新功能InChorus，解决了不同搜索引擎之间糖肽识别差异的难题。InChorus整合了来自多个搜索引擎的结果，高亮展示多搜索引擎共识鉴定与单搜索引擎独有发现的糖肽。并提供一个共识评分，用于衡量糖肽-谱图匹配结果在多搜索引擎间的一致性与置信度。

多个O糖基化位点分析

GlycanFinder 的完整糖肽数据库搜索现已支持自定义每条糖肽上O糖的位点数，最多可设置5个，实现准确的复杂糖肽鉴定和糖基化位点定位。尽管组合搜索空间显著扩大，GlycanFinder 通过应用高效过滤算法、位点特异性定位评分以及基于结构的匹配策略，在保持快速分析性能的同时，仍能提供高置信度的糖基化位点鉴定结果。

配对谱图支持

HCD-pd-EThcD混合谱数据分析，可实现糖链结构与糖基化位点的高置信度鉴定。GlycanFinder 可分别显示同一条糖肽的HCD和EThcD的注释谱图，便于用户直观解析鉴定结果。

聚糖修饰分析

PEAKS^® GlycanFinder 提供全面的糖组学分析方案，用于表征具有多种修饰的糖肽以及游离糖，以解决聚糖修饰带来的分析挑战。

高重现性的价态匹配

价态匹配通过整合所有前体特征（包括未获得MS2鉴定的特征）来提升分析的重现性。肽段通常会产生多种电荷态，若仅依赖已鉴定的前体进行糖链分析，可能导致结果偏差。价态匹配能够检测到更多相关前体，并利用组合特征峰面积进行谱图分析。

定制聚糖数据库

糖链数据库编辑器通过直观的用户界面，使用户能够构建自定义糖链数据库。用户可通过结构绘制工具添加、编辑和修改糖链结构，并轻松将其导入软件中。

聚糖网络

Glycan Network展示了各种糖型之间的关联，每条边连接的两个糖之间仅有一个糖单元组成不同，因此可将具有共同核心结构的、末端不同的糖全面可视化。使用户能够清晰观察各糖链从共同核心结构向外延伸的糖基化分支模式。

糖基化肽组学分析

糖基化肽组工作流，无需依赖数据库，能够发现和表征全新的糖基化肽，用于免疫肽组学研究。最近的一项研究表明，GlycanFinder能够发现一种N-糖基化肽，该肽被认为是在阿霉素耐药性乳腺癌细胞系中具有药物耐药性的生物标志物。

仪器商中立的分析软件

为实现最佳的糖肽鉴定性能，GlycanFinder 整合了通过不同碎裂方式数据集训练的优化算法。软件可支持多种质谱设备。