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DeepAB 是一套功能强大的表征套件,专为支持抗体衍生生物制品的研发而设计。从精准的从头序列鉴定,到翻译后修饰(PTMs)、聚糖及药物偶联位点的深度分析,我们的服务能提供关键见解,助力优化产品的功能、稳定性与可制造性。该平台包括:

释放抗体潜力

单克隆抗体(mAb)药物的成功为下一代基于抗体的疗法铺平了道路,包括双特异性和多特异性抗体、抗体药物偶联物(ADC),甚至多克隆疗法。然而,随着基于抗体的疗法不断发展演进,对全面生物分析方法的需求也日益增长,以满足监管要求。

DeepAB 是一套功能完备的抗体测序与表征服务组合,助力抗体类生物药的研发工作。从精准的从头序列鉴定,到翻译后修饰、糖基化以及药物偶联位点的深度解析,该平台可提供关键数据支撑,帮助优化抗体的功能、稳定性与可生产性。

关键服务优势

  • 全面表征方案 —— 多层级质谱分析流程,实现抗体全维度解析。
  • AI 驱动的数据挖掘 ——自研专属软件集成国际前沿深度学习算法,提升数据解析能力。
  • 高级序列解析 —— 精准区分质量数相同的氨基酸残基,实现三级水平的亮氨酸 / 异亮氨酸判别,并提供基于深度学习的保留时间预测。
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我们的标准分析流程整合Top‑down与Bottom‑up质谱技术,实现高精度全长蛋白序列的构建与验证。

实验采用溶液内酶解样品处理方案,搭配五种不同蛋白酶进行酶切,保障蛋白序列实现完整覆盖。利用液相色谱‑质谱联用(LC‑MS)采集肽段原始谱图数据,依托自研高级软件完成从头测序与序列拼接,最终获得全长蛋白序列。所有项目均配套人工核验与序列解析步骤以保证结果可靠;通过比对理论分子量与去卷积后的完整蛋白分子量,完成最终序列确证。除此之外,整套方案还可实现糖基化全面图谱解析与翻译后修饰(PTM)分析,为抗体的结构及功能研究提供更为深入的依据。

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  • 完整报告包括
    • 实验操作流程
    • 附带序列覆盖度视图的全长蛋白序列
    • 互补决定区(CDR)对应的佐证质谱谱图
    • 完整分子量验证(误差范围 ±2 Da)
    • 每个氨基酸位点均由 20 条唯一肽段提供数据支撑
    • 异亮氨酸 / 亮氨酸(Ile/Leu)区分鉴定
  • 可按需提供项目工程文件与原始质谱数据
  • 可提供结果解读
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  • 溶液中抗体 100 μg
  • >80%纯度
  • 物种类型
  • buffer 信息
  • 样品必须不含洗涤剂和聚合物(如Triton X-100、Tween-20、PEG等)

采用优化的液相色谱(LC)方案,可高效从复杂样本中分离分辨简单抗体混合物。将每一个液相色谱馏分均分为三份,分别用于 intact、bottom-up 和 top-down 三种模式进行数据采集。所有数据均导入 PolySeq.AI 软件进行整合分析,完成多条抗体序列变体的精准拼接。完整分子量测定可实现抗体重链与轻链的正确配对。

本项服务还可联合 B 细胞测序技术开展交叉比对与结果验证。两种技术联用,既可揭示免疫系统背后的基因组基础,也能筛选获得具备功能性的优势抗体序列。所有分析流程均包含人工核验与序列解析,项目结题后交付完整分析报告。糖基化图谱分析与翻译后修饰定向检索可作为本服务的可选增值模块。

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  • 完整报告包括
    • 每个样品馏分中,至少完成丰度排名前 4 位抗体的全长序列解析,并提供肽段覆盖度视图
    • 完整分子量测定,同时完成抗体重链‑轻链配对分析
    • 自顶向下肽图分析与碎片离子注释
    • 三级分层策略实现异亮氨酸 / 亮氨酸(I/L)区分鉴定,并配套支撑统计数据
    • 获得覆盖抗体可变区的高质量肽段质谱谱图
  • 可提供结果解读
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  • 溶液中抗体 1mg
  • >95% 纯度
  • 物种类型
  • buffer 信息
  • 样品必须不含洗涤剂和聚合物(如 Triton X-100、Tween-20、PEG等)

生物分析方法是抗体-药物偶联物(ADC)开发中的关键组成部分,用于药理学考虑,如最佳剂量策略、药物效力、安全性和有效性。在研究和开发的早期阶段,这包括识别抗体中连接子和载荷结合的位点,计算药物与抗体的比率,以及表征样品中不同的ADC蛋白形态。为此,我们优化了完整的工作流程,包括样品准备、仪器安装和数据分析。重要的是,我们整合了完整的自上而下和自下而上的质谱数据,以深入表征ADC产品。

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三个层级的质谱数据均导入 ProteoformX 软件完成整合分析,从而精准定位药物偶联基团在抗体亚基上的具体修饰位点。

完整报告包括

  • 完整分子量分析与药物抗体比(DAR)计算
  • 肽图分析,依托二级质谱(MS/MS)谱图验证药物偶联位点
  • Top-down 质谱分析获得序列覆盖信息,并完成偶联位点定位
  • 抗体全长序列解析(区分异亮氨酸 / 亮氨酸);若序列未知,提供覆盖可变区的二级质谱(MS2)佐证谱图
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  • 溶液中的抗体含量 50 μg
  • >95%纯度
  • 抗体序列信息(若已知)
  • buffer 信息
  • 共轭的结构与质量
  • 结合残留物
  • 样品必须不含洗涤剂和聚合物(如Triton X-100、Tween-20、PEG等)。

双特异性抗体具备可同时结合两种不同抗原的独特功能。这类 T 细胞衔接分子(TCE)能够充当桥梁,直接介导免疫细胞与病变细胞产生相互作用。开发 TCE 产品的核心环节之一,是确认目标产物构建正确,并完成关键质量属性的评估。

依托 ProteoformX 软件整合多维度质谱数据,开发了一套双特异性抗体完整表征分析服务。多层级数据联合解析可深度揭示分子结构信息,分别在完整分子、蛋白亚基以及肽段水平上完成各项关键质量属性的定位分析。

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Intact Mass 分析

首先开展完整分子水平分析,用于评估样品整体纯度,并将主要色谱峰与双特异性抗体的理论预期分子量进行匹配,以此鉴别各类错配配对产物,具体结果见下文展示。

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Top-Down 分析

随后开展 Top-Down 蛋白质组学分析,在抗体独立亚基水平上获取详细分子信息。通过鉴别全长型与截短型抗体亚基,实现产品稳定性评估;同时可输出各类亚基蛋白变体(即修饰型与未修饰亚基)的相对丰度数据。

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Bottom-Up 结合 Top-Down 分析

随后将bottom-up分析数据与top-down分析数据联合整合,实现序列二次确证、翻译后修饰的精准定位以及糖型图谱解析。
采用多种酶解方式获得自下而上肽段数据,将肽段序列匹配至抗体亚基,最终完成各蛋白变体亚基的关联归属。

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完整分子量分析(附带峰标注):

  • 完整抗体与理论分子量匹配验证
  • 抗体配对形式分析
  • 杂质与宿主细胞蛋白的检出
  • 还原 / 去糖基化重链、轻链分子量测定

Top-down分析:

  • 全部抗体亚基鉴定,截短变体筛查
  • 翻译后修饰与糖链的位点定位

Bottom-up分析:

  • 序列确证、序列变异体筛查,翻译后修饰 / 糖链精准定位
  • 溶液中的抗体含量 200 μg
  • >85% 纯度
  • 抗体理论氨基酸序列
  • buffer 信息
  • 样品必须不含洗涤剂和聚合物(如Triton X-100、Tween-20、PEG等)。

无论是单次测序分析、常规质量检定,还是长期规模化项目,我们均可提供全方位支撑。

联系我们预约免费咨询,共商您的项目细节。我们将协助您制定最优实验方案,确保项目迅速推进且价格合理。

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若您希望获取更多详情资料,了解我们的方法与经验为何能为您带来前所未有的出色成果;或是有任何疑问,我们都随时为您解答。