PEAKS Studio 13.5在发现与靶向分析工作流中均新增多个全新功能！
DDA工作流新增
>Open PTM：可辅助完全未知的翻译后修饰类型及位点的挖掘。
>DDA Proteome多轮搜索（Multi-round Search）：可实现全面的多物种复杂样本分析。
DIA工作流新增
>DIA PEAKS PTM：无需依赖谱图库，直接实现更深层次的蛋白质组学DIA谱图中未知PTM的解析与发现，为用户开展高阶蛋白质组学研究提供前所未有的算法支撑。
DDA Open PTM搜索实现蛋白质组学的深度分析
PEAKS全新的Open PTM 搜索算法为未知翻译后修饰的鉴定与表征提供了高效、灵敏且通用性强的技术方案，提供无偏的PTM谱图解析结果。在该分析中，我们的算法针对未与数据库匹配的高质量质谱图，在较宽的母离子质量容差范围内进行进一步解析。
DIA PTM解锁蛋白质组暗物质
依托深度学习从头测序的辅助，突破传统谱图库搜索与数据库搜索的限制，我们的DIA分析工作流中的PEAKS PTM功能将分析范围拓展至蛋白质组学中尚未被探索的“暗物质”。不依赖谱图库，可直接从DIA数据中进行未知PTM的无偏鉴定，以及全新肽段的发现。
支持多数据库多轮搜索
数据库补充搜索选项适用于DDA蛋白质组数据重分析场景，该分析针对未与目标数据库匹配但de novo得分较好的谱图，与补充数据库进一步匹配，实现更高的谱图解析率。
提升DIA性能
DIA分析性能和速度进一步提升，确保为复杂的生物学研究提供更加准确、全面的分析结果。同时，定量重现性也进一步提高，protein group的定量变异系数（CV）低于10%。
其他功能优化
命令行界面（CLI）：将CLI集成到PEAKS Studio中，实现自动化分析流程。
MRM支持：除了PRM/MRMHR数据外，PEAKS Studio现已支持对MRM采集的目标母离子-子离子对进行定量分析。
Spiked Peptide列表：DDA与DIA肽组学工作流可实现PTM位点定位，例如添加重标同位素多肽进行实验验证。。
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The PEAKS Team
Bioinformatics Solutions Inc.
