我们始终建议用户导入直接来自仪器的未处理原始数据,以便 PEAKS 软件能够调取完整的实验原始数据,其中包含质谱全扫描数据与保留时间相关信息。

若要导入不同厂商的仪器原始数据,PEAKS 软件可能需要安装对应的第三方软件。如下表所示,所需的这类第三方软件中,多数均为您的系统中已预装的仪器原厂配套软件。


仪器数据格式

VendorInstrumentData TypeConverter & Set Up
ThermoIon Trap / OrbitraprawMSFileReader
AgilentIon Trap / Q-TOFyep / dCompassXtract / MassHunter
BrukerQ-TOF / Ion Trap / timsTOF Pro / TOF TOFbaf / yep / tdf / liftCompassXtract
SCIEXTripleTOF / QSTAR / QTRAP
TOF TOF
wiff
t2d
ProteoWizard-MSConvert
Extractor
ShimadzuAXIMA-CFRrunKratos Converter
VarianFTICR / Ion Trapsms / xmsVarianMS
WatersQ-TOFrawMassLynx

额外支持的标准数据格式

  • .DAT (AB converter)
  • .DTA (Sequest)
  • .MGF (Mascot)
  • .mzData (HUPO format)
  • .mzML (including mzIdentML)
  • .mzXML
  • .PepXML
  • .PKL (MassLynx)
  • .XML (mzData schema)
  • .XML (mzXML schema)