深入糖蛋白组学和糖组学分析的高级解决方案

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核心功能
仪器商中立的分析软件
为实现最佳的糖肽鉴定性能,GlycanFinder 整合了通过不同碎裂方式数据集训练的优化算法。软件可支持多种仪器设备。

增强聚糖结构解析可信度
GlycanFinder 采用基于结构的糖肽鉴定方式。S-Score (%)用于表征所选糖肽结构相较于其他聚糖同分异构体候选物的支持程度表示所选糖肽结构相对于其他异构糖链候选物(即具有相同组成但结构不同的糖链)的支持强度。

用户友好的操作界面
PEAKS GlycanFinder 提供了直观易用的操作界面,显著简化了糖链分析流程。用户可通过交互式、信息丰富的可视化查看器深入探索分析结果,并能便捷地导出相关数据,用于团队共享或下游生物信息学分析。

多-O 聚糖搜索
GlycanFinder 3.0 支持在单个肽段上同时搜索多达五个O-连接糖链,从而实现对高度糖基化O-糖肽的鉴定。尽管组合搜索空间显著扩大,GlycanFinder通过应用高效过滤算法、位点特异性定位评分以及基于结构的匹配策略,在保持快速分析性能的同时,仍能提供高置信度的糖基化位点鉴定结果。

配对谱图支持
新型HCD-pd-EThcD采集方法可实现高置信度的糖链结构解析和糖基化位点定位。全新的配对谱图功能提供直观的并列式的分析界面。

聚糖从头测序
当糖肽谱图无法与现有数据库匹配时,PEAKS GlycanFinder 可通过 N – 糖链从头测序技术,直接从谱图中推断糖链结构。这一功能能够助力发现已配置聚糖数据库中未包含的额外糖链结构。

聚糖修饰分析
糖链修饰(如磷酸化)可扩展糖链多样性,并可能作为疾病标志物。PEAKS GlycanFinder 能够对具有多种糖链修饰的糖肽及游离糖链进行全面分析。


高重现性的价态匹配
价态匹配通过整合所有前体特征(包括未获得MS2鉴定的特征)来提升分析的重现性。肽段通常会产生多种电荷态,若仅依赖已鉴定的前体进行糖链分析,可能导致结果偏差。价态匹配能够检测到更多相关前体,并利用组合特征峰面积进行谱图分析。

定制聚糖数据库
糖链数据库编辑器通过直观的用户界面,使用户能够构建自定义糖链数据库。用户可通过结构绘制工具添加、编辑和修改糖链结构,并轻松将其导入软件中。

InChorus – 跨软件结果比对
不同搜索软件对糖肽的鉴定结果可能存在差异,因此GlycanFinder 3.0 引入了 InChorus 功能,用于整合多个搜索软件的输出结果。此项功能可突出显示共识鉴定结果和独特鉴定结果,可视化展示结果重叠情况,并提供便捷的筛选和导出功能。

聚糖网络
聚糖网络能够直观地展示不同糖链组成之间的生物合成网络关系,其中每条连线连接两个仅相差一个单糖的糖链结构。这种可视化方式使得从共同核心结构延伸出的不同糖链分支一目了然。

高灵敏度分析
升级的评分算法通过整合碎片离子强度、聚糖特异性特征离子、肽段骨架离子及互补碎裂模式,显著提升了分析灵敏度。这一优化改善了低信号谱图的检测能力,实现了糖肽的高可靠性鉴定。

References
- Pinho, S., Reis, C. Glycosylation in cancer: mechanisms and clinical implications. Nat Rev Cancer 15, 540–555 (2015). doi:10.1038/nrc3982
- Sun, W., Zhang, Q., Zhang, X. et al. Glycopeptide database search and de novo sequencing with PEAKS GlycanFinder enable highly sensitive glycoproteomics. Nat Commun 14, 4046 (2023). doi:10.1038/s41467-023-39699-5
- Korkola, N., Jurcic, K. PEAKS GlycanFinder 2.5: Launching a New Era for Glycoproteomics and Glycomics. Bioinformatics Solutions Inc (2025). https://www.bioinfor.com/peaks-glycanfinder-2-5-launching-a-new-era-for-glycoproteomics-and-glycomics

















