波士顿大学与波士顿医学中心近期在 bioRxiv 预印本平台发布一篇论文。该研究表明，可在人类肾活检样本中，对胶原蛋白翻译后修饰与基质组蛋白进行定量，为阐明纤维化向不可逆阶段进展的机制提供了全新思路。
研究团队聚焦间质纤维化伴肾小管萎缩（IFTA），这是终末期肾病最常见的终末通路。研究对福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）临床活检样本开展激光显微切割（LMD），选取 1 例糖尿病肾病样本，对比其中健康区域与慢性损伤的肾小管间质；同时纳入肾移植供体来源的健康组织作为对照。
样本检出大量尿调蛋白（UMOD）、钠钾氯协同转运蛋白（SLC12A1）等典型肾小管间质特征蛋白，肾小球蛋白检出量极低，证实该取样方式具备组织分区特异性。在间质纤维化伴肾小管萎缩病变区域，COL1A1、COL6A3 等胶原蛋白以及腱生蛋白 C 的丰度更高。羟脯氨酸是含量最高的修饰类型，其次为羟赖氨酸。所有准确定位的羟脯氨酸位点均为 4 – 羟脯氨酸，且这类修饰在移植来源健康组织中丰度最高。
该研究采用 PEAKS® Studio ，基于从头测序辅助蛋白质组学工作流，完成所有LC-MS/MS数据的蛋白鉴定、翻译后修饰图谱解析与无标记定量。PEAKS® 的翻译后修饰检索功能在识别胶原链上的羟脯氨酸、羟赖氨酸、羟赖氨酸己糖修饰中起到关键作用。研究仅保留位点定位分数 AScore≥20（p＜0.01）的位点；尽管羟脯氨酸与羟赖氨酸具有相同质量偏移，该筛选策略仍可在肽段水平实现高置信度修饰位点定位。研究总共鉴定到 852 个蛋白组、817 种唯一蛋白及 6516 条肽段；经过重复性过滤后，对 671 种蛋白、2821 条肽段完成定量。其中，54 条羟脯氨酸修饰肽段、5 条羟赖氨酸修饰肽段满足置信标准，COL1A2 与 COL4A2 上承载的这类修饰位点数量最多。
该研究仅利用少量存档样本，同时获取蛋白水平与位点水平的翻译后修饰数据，为发掘慢性肾病进展的早期分子标志物、以及纤维化新型治疗靶点奠定基础。
原文文献：Langston, J.C., Candib, A., Sethi, M., Henderson, J., Zaia, J. (2026) Proteomics of highly post-translationally modified proteins in kidney tubulointerstitium. bioRxiv. https://doi.org/10.64898/2026.09.30.755814
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