MR1 配体交联鉴定维生素 B6 代谢物为 TCR 反应性抗原

PEAKS® Studio 提供完整的自下而上的蛋白质组学解决方案,具有更高的准确性、灵敏度和速度。能够全面支持主流质谱仪器的支持数据依赖采集(DDA)和数据非依赖采集(DIA)原始数据,并针对多种应用场景更新了相应的工作流程(如经典和非经典多肽/蛋白质的深度鉴定),为用户提供全面的解决方案,助力相关研究迈向新高度!

发表在Cell Reports Methods上的一项新研究开辟了免疫肽组学的新方向。传统方法侧重于经典 MHC 分子呈递的肽段,而研究人员则提出了一个不同的问题:我们如何分析非肽类抗原?

这项研究通过分析结合于 MR1(一种非经典 I 类 MHC 样分子)的小分子配体,拓展了该领域的研究范围。研究团队采用一种巧妙的交联方法,将 MR1 与维生素 B6 衍生代谢物之间的瞬时相互作用进行共价稳定,使这些复合物能够通过质谱检测到。

随后,他们借助 PEAKS Studio 软件分析质谱数据,检索匹配经过人工审核的 SwissProt 人源蛋白条目。依据预期交联化学反应,自定义 Ac-6-FP 修饰并设置为可变修饰。并根据实际情况与分析需求设置其余检索参数。这些小分子鉴定为报告肽上的翻译后修饰,并进一步明确了其质量、组成和特异性。为探索非传统抗原呈递和 T 细胞识别开辟了新的可能。

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原文链接:MR1-ligand cross-linking identifies vitamin B6 metabolites as TCR-reactive antigens: Cell Reports Methods