PEAKS® Online 13.5 对数据依赖采集（DDA）与数据非依赖采集（DIA）分析工作流完成了全新重构，搭载优化升级算法，打造更简洁易用的分析流程。软件界面全面焕新，数据处理与系统运行稳定性大幅提升，简化参数配置步骤，助力科研人员实现更高水准的蛋白质组学解析。软件符合 CFR 法规的数据管理规范，可在临床、工业全场景下保障数据完整性、数据安全，并完成监管审计前置筹备工作。

PEAKS Online 13.5 搭载两大特色工作流：大队列自动化分析流程与实时质控流程，配套一体化操作界面，可实现质谱仪器原始数据全自动导入解析，并同步开展实时数据质量评估。

一、大队列自动化分析功能

PEAKS Online 13.5 提供一套自动化、实时化蛋白质组数据分析管线，集成质谱仪器状态监控、极简数据处理流程与累积式结果总览面板，大幅加快大队列数据集的质控校验与数据挖掘效率。

二、实时质量控制功能（PEAKS Online 独家功能）

该首创工作流内置Instrument Daemon，可自动完成质控样本批量筛查。整套流程高度精简，在质谱数据采集全程实时评估实验技术偏差；一旦质控指标不满足预设判定标准，系统将第一时间向用户推送告警通知。

三、Open PTM Search搜索

PEAKS 自研的OpenPTM检索算法，为未知翻译后修饰（PTM）鉴定提供高效、高灵敏度、无偏的完整解决方案，兼容各类实验方案，覆盖多种酶切模式与同位素标记定量体系。